Для программирования выбрал платформу .NET, для общения с платой E440 воспользовался драйвером оберткой e440vi.dll. Все работает нормально. Почему для последующих версий драйверов не были сделаны подобные dll ? и какие возникнут проблемы если я сделаю такой dll сам?

Если сами сделаете - никаких проблем...