Можно ли читать в БИОСе цифровые выходы так же, как и входы: AR=IO(TTL_OUT), или есть другой вариант получения цифровых выходов?

Нет. В железе модуля не предусмотрено получение состояниия выходных линий. Можно посоветовать завести переменную, в которой и хранить текущее состояния выходных линий.

По идее, эта переменная ужен есть - по адресу TtlOutAddr, так?

Да.