Скажите, а платы на шине PCI (которые вы предлагаете) по своим возможностям не уступают платам на шине ISA?

Нет, не уступают. Даже превосходят
К тому-же они комплектуются 32-разрядной библиотекой и программой многоканального осциллографа - спектроанализатора - регистратора под Windows.

Дело в том, что я вижу возможность установки большого количества внешней памяти на платы ISA, а на PCI - нет. Или там прямо в память компьютера данные DSP может писать? Не скажется ли это на времени выборки? Если можно поподробнее. Можно на мыло.

PCI-платы позволяют сбрасывать все данные на компьютер в реальном времени. Поэтому им не нужна большая память. На времени выборки это не сказывается.