Мы закупили новые платы L783-86 (до этого использовали в своих системах L783 на ADSP-2184).
Вопросы:
1) Нужно ли переустанавливать драйвер для использования всего буфера FIFO АЦП?
2) При установке нового ПО - устанавливаемая bios использует все 6 кВ FIFO?
3) Почему исходники bios на фирменном CD все еще с 2кВ? (нужно самим править адреса переменных?)

Первые два вопроса снимаются. Остается только последний вопрос. Конечно, если отличия только в этом, добавить фиксированное смещение к адресам не сложно.
Наверно, все-таки на фирменном (!!!) CD должна быть новая версия.

FIFO буфер платы конфигурируется чисто программным образом: переменная FIFO в функции FillADCparameters_PLX() заказывает размер FIFO, а ф. SetParameters() передаёт этот размер в LBIOS платы. Максимальный размер FIFO буфера зависит от типа DSP, установленного на плате и прописанного в ППЗУ. Функция LoadBios() загружет LBIOS в плату, определяет тип установленного DSP и соответствующим образом настраивает LBIOS на него. LBIOS по умолчанию натроен на работу с ADSP-2184, поэтому все адреса переменных в LBIOS начинаются с 2xxxH. Если же обнаруживается наличие  ADSP-2186/2185, то производится корректное модифицирование всех адресов переменных, начиная их с 3xxxH (см. исходные тексты LBIOS, а именно файл L783.dsp, а ещё конкретнее выполнение команды Set_DSP_Type_cmd). Так что править самим нет никакой необходимости )))).

Т.е. я могу смело добавлять свои переменные в var.h как будто для 2184?

Именно так: считать что у Вас ADSP-2184.

Еще один вопрос:
можно ли не переустанавливать старый драйвер и соотв. ПО (которое шло в комплекте к L783-84), а заменить только плату L783-86?

Да можно.