E14-140:
Допускается ли подавать на вход GND32 положительное Uref относительно AGND, чтобы при однофазном режиме измерения сместить нули отсчетов в отрицательную область? Uref порядка половины максимального входного сигнала, сигнал неотрицательный.

Вопрос хороший. Поясню подробно.
----------------
В спецификации E14-140 сказано, что напряжение синфазного сигнала входа АЦП для любого установленного поддиапазона может находиться в диапазоне +-10V. Это значит, что рабочее напряжение на каждом из входов X1,...,X16,Y1,...,Y16 и GND32 может находиться в диапазоне +-10V, при этом, для дифференциального режима разность потенциалов Xi-Yi для i-того входа должна укладываться в установленный поддиапазон, а для однофазного режима -- разность потенциалов Xi-GND32 и Yj-GND32 должна укладываться в установленный поддиапазон E14-140.

Итак, в Вашем вопросе, если указанные мной условия соблюдаются, то всё будет корректно!
При этом, обращаю Ваше внимание, что подключение обязательно должно быть трёхполюсным:
1-ый полюс: точка нулевого потенциала (относительно которой включен Ваш источник напряжения Uref) должна  быть соединена с AGND     
2-ой полюс: напряжение смещения на Uref подать на GND32
3-ий полюс: точка однофазного входа i-того канала
Xi, Yi должна быть соединена с выходом источника Вашего сигнала (назовём его Usig), общий провод которого соединён с AGND.
Включенный по этой схеме однофазный вход E14-140 фактически будет осуществлять функцию двойного вычитания, т.е. если U-это напряжение на входе преобразователя, которое будет оцифровываться E14-140, то
     U=Xi-Uref-Usig    или
     U=Yi-Uref-Usig

Замечу, что для однофазного (32-канального) режима
в этой схеме мы будем иметь общее напряжение смещения Uref для всех входов, а для дифференциального режима подобную схему можно организовать с индивидуальным Uref_i для каждого i-того канала, если эти источники Uref_i включены относительно общей цепи АGND 

------------
Надеюсь, я понятно объяснил?

Большое спасибо за ответ, в принципе, с учетом документа lcardconnect.pdf, все ясно
Только не понял о двойном вычитании
- почему не просто
U=K(Usig-Uref), K=0.25,1,4,8; Usig=Uxi или Uyi

И еще вопрос-
где лучше разместить источник Uref?

В документации рекомендовано соединять GND32 с AGND непосредственно на входе модуля E14-140, т.е. можно предположить, что и источник Uref (что-то типа 78l05) также лучше размещать на входе модуля (например, прямо в корпусе аналогового разъема). Тогда подключение будет также трехполюсным - но двухпроводным (между источником сигнала и модулем).
Или разместить источник Uref в корпусе  источника Usig ("прибора"), привязав его к питанию и земле выходных буферов сигналов?

Согласен, формула U=K(Usig-Uref) правильнее описывает то, что я хотел сказать вчера, и мой термин "двойное вычитание" здесь неудачен.
Теперь по поводу источника Uref и где размещать для предложенного выше однофазного подключения. Требования противоречивы, поскольку с одной стороны, размещать нужно близко к E14-140, чтобы уменьшить коммутационную помеху из-за звона на длинных проводах, с другой стороны, общий провод GND32 c источником Uref должен находиться электрически близко от общих проводов источников сигналов, чтобы не "нагрести" на длине общего провода большую помеху -- это естественное противоречие любого однофазного входа. Замечу, что для дифференциального режима таких противоречий нет, хотя для многоканального режима E14-140 короткие провода и низкоомные источники сигналов желательны в любом случае.
Теперь по поводу 78l05. Это стабилизатор, с которого выходной ток можно снимать в одном направлении, а коммутационные явления на входах E14-140 -- двуполярные по току. Вероятно, стабилизатор нужно нагрузить по выходу не только ёмкостью, но и активной нагрузкой, чтобы он более-менее правильно работал. Я уже не говорю о том, что у дешёвого стабилизатора (как 78l05) могут присутствовать негативные явления в виде шума, температурного и временного дрейфа (мы ведь с 14-битным АЦП всё-таки работаем). Тут источник опорного напряжения с двуполярным выходом больше бы подошёл... Хотя, и Ваших требований к устройству я тоже не знаю.