Если на плате запущен синхронный сбор данных с некоторых каналов и осуществляется их передача по Bus Master в оперативную память, то можно ли при этом одновременно асинхронно(через IoAsync) считывать показания других каналов и работать с ТТЛ входами/выходами?

Каналы читать нельзя, с цифровыми можно.