Задача: требуется обеспечить точность и стабильность частоты АЦП на карте L-780 до примерно такой величины: 0.00001 - 0.0001.

Возможно ли это на каком-либо уровне? Особенно интересует софтверное решение данной задачи (в смысле без переделки железа и подключения внешнего синхронизатора).

Кто-нибудь что-нибудь знает по этой теме?

Модифицируй лбиос или пробуй линуксовые проекты типа rtlinux, rtai. Я выбрал внешнюю опорную частоту потому как в моём случае требования к стабильности ещё выше.

To: Стас
А у тебя есть основания полагать, что частота кварца на плате уходит ?

Обычный кварц на 3-й гармонике имеет в лучшем случае 30..50ppm долговременной нестабильности.Т.е. +-50E-6c в год.Плюс в моём случае нужна одинаковая стабильность таймера ОС и частоты сбора данных. Генератор ГК62ТС от Мориона даёт 2x10E-9с (0.002ppm в год) на частоте например 10МГц отклонение составит 0.02Гц. От него я получаю сетку частот сбора данных и собираюсь синхронизировать ОС. (пока ещё не доделал)

О, это более чем достаточно - у меня две платы работают синхронно по времени, и переодически внутренний голос задавался вопросом - а не надо ли делать какую-нибудь внешнюю синхронизацию.
Что касается синхронизации с ОС - все может быть очень плохо, где-то я читал жалобы на уход PC-ых часов вплоть чуть ли не на час в сутки. Хотя жалобы были от виндоуз юзеров и сам я такого не наблюдал.
Опять-таки не совсем представляю, как можно с такой дикой точностью засинхронизоваться с многозадачным OSом -  разве что останавливать все и заставлять работать с заполненными кешами процессора

Про точность синхронизации с ОС я ни слова не написал;))) Единицы микросекунд можно получить в линуксе используя ntpd+PPSKit, это меня пока устраивает.

Возможна ли  калибровка и проверка платы L-1450 и с помощью чего?

Обычно это делается по-другому: Обе платы работают от одного генератора. И никакая синхронизация не нужна. Так что тут два варианта
1. Доработка плат (подключение генератора одной платы к другой)
2. Смена типа плат (например, на NI - там такая возможность есть).